在大型制药公司工作了近二十年后,化学家蒂姆·塞尔纳克(Tim Cernak)在2018年感到自己需要做出改变。在默克(Merck)任职期间,他开发了针对癌症、HIV和糖尿病的高精度疗法——这些药物能够精准攻击疾病,同时最大程度减少对健康细胞的损害。但作为一名从小热爱自然的人,他越来越关注生物多样性流失和自然界的奇迹,并开始思考:人类是否可以从自然界的分子宝库中寻找更好的药物?
从合成化学到自然启发
塞尔纳克的转变并非偶然。过去一个世纪,制药行业主要依赖合成化学——在实验室里建造新分子。然而,自然界在数百万年的进化中已经筛选出大量具有生物活性的化合物。从阿司匹林(来自柳树皮)到紫杉醇(来自太平洋紫杉),天然产物一直是药物发现的重要来源。但随着化学合成能力的提升,许多制药公司逐渐放弃了天然产物筛选,转而追求更可控的合成路线。
“大自然是最好的化学家——它已经完成了数百万年的实验。我们只需要学会如何读取它的配方。” ——蒂姆·塞尔纳克
塞尔纳克认为,借助现代工具——特别是人工智能、机器学习和自动化高通量筛选——人类可以重新审视大自然中的分子,并以前所未有的效率发现新药。他的新角色被称为“大自然药物设计师”,这不仅仅是收集植物或微生物提取物,而是深入理解自然界的化学逻辑,并利用AI预测哪些分子可能具有治疗潜力。
技术与自然的融合
在塞尔纳克的工作流程中,他首先从全球各地的土壤、海洋和雨林样本中提取DNA或代谢物数据。然后,通过机器学习模型分析这些化学结构,预测它们与疾病靶点的结合能力。最后,在实验室中用自动化系统合成和测试最有希望的候选分子。这种方式大大降低了传统天然产物研究中的试错成本,并缩短了从发现到临床的时间。
例如,他的团队曾从一种巴西雨林真菌中识别出一个此前未知的分子,该分子在AI预测中显示出抗菌活性。经过验证,它对多重耐药金黄色葡萄球菌(MRSA)有效,而传统方法可能要花费数年才能发现这一点。
编者按:药物发现的范式转变
塞尔纳克的故事不仅是一个个人的职业转型,更象征着制药行业正在发生的深刻变化。随着地球生物多样性持续减少,我们可能正在失去潜在的救命分子。大自然药物设计师这一角色,本质上是将生态保护与药物创新捆绑在一起——因为只有保护了自然栖息地,才能继续挖掘其中的化学宝藏。此外,AI的加入使得人才需求发生改变:未来的药物化学家不仅需要精通有机合成,还要具备数据素养和生态学视野。
值得注意的是,这一转变也面临挑战:天然产物往往结构复杂,合成难度高;监管机构对混合物或复杂天然来源药物的审批标准尚未完善。但无论如何,塞尔纳克和越来越多的科学家已经踏上了这条路,他们相信,未来的药柜里,将有很多药物来自“大自然的处方”。
本文编译自MIT Technology Review
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